Sinopsis
Setelah kehancuran Wangsa Atreides oleh Wangsa Harkonnen, Putri Irulan, putri Kaisar Padishah Shaddam IV, menulis jurnal tentang pengkhianatan ayahnya terhadap Atreides. Di Arrakis, pasukan Fremen Stilgar menemani Paul Atreides dan ibunya yang merupakan anggota Bene Gesserit yang sedang hamil, Lady Jessica, ke Sietch Tabr. Beberapa anggota Fremen menduga mereka adalah mata-mata, sementara Stilgar dan yang lainnya melihat tanda-tanda ramalan bahwa seorang ibu dan anak dari "Dunia Luar" akan membawa kemakmuran bagi Arrakis.
Anggota Fremen menerima Paul tetapi Stilgar memberi tahu Jessica bahwa ia harus menggantikan Ibu Pendeta Sietch Tabr yang sedang sekarat dengan meminum Air Kehidupan, obat yang mematikan bagi pria dan wanita yang tidak terlatih. Ia menggunakan pelatihan Bene Gesserit-nya untuk mengubah cairan tersebut dan bertahan hidup, mewarisi ingatan semua Ibu Pendeta sebelumnya. Cairan tersebut secara prematur membangunkan pikiran putrinya yang belum lahir, Alia, yang memungkinkan Jessica untuk berkomunikasi dengannya. Mereka sepakat untuk fokus meyakinkan Fremen utara yang lebih skeptis tentang ramalan tersebut. Chani dan temannya, Shishakli, benar-benar percaya bahwa ramalan itu dibuat-buat untuk memanipulasi Fremen, tetapi Chani mulai menghormati Paul setelah dia menyatakan bahwa dia hanya bermaksud untuk bertarung bersama Fremen, bukan untuk memerintah mereka.
Paul dan Chani jatuh cinta saat Paul membenamkan dirinya dalam budaya Fremen: mempelajari bahasa mereka, menjadi pejuang Fedaykin, menunggangi "cacing pasir terbesar yang pernah ada", dan menyerbu operasi rempah-rempah Harkonnen. Paul mengadopsi nama Fremen "Usul" dan "Muad'Dib". Karena penyerbuan rempah-rempah yang terus berlanjut, Baron Vladimir Harkonnen menggantikan keponakannya, Rabban, sebagai penguasa Arrakis dengan keponakannya yang lebih muda yang licik dan psikopat, Feyd-Rautha. Lady Margot Fenring, seorang Bene Gesserit, dikirim untuk mengevaluasi Feyd-Rautha sebagai calon Kwisatz Haderach dan mengamankan garis keturunan genetiknya.
Jessica melakukan perjalanan ke selatan untuk bersatu dengan kaum fundamentalis Fremen yang sangat percaya pada ramalan tersebut. Paul tetap berada di utara, takut bahwa visinya tentang perang suci apokaliptik akan menjadi kenyataan jika ia pergi ke selatan sebagai seorang mesias. Selama penyerbuan terhadap pemanen rempah penyelundup, Paul bertemu kembali dengan Gurney Halleck, yang membawa Paul ke gudang hulu ledak atom tersembunyi milik House Atreides. Feyd-Rautha melancarkan serangan dahsyat di Fremen utara, menghancurkan Sietch Tabr, membakar hidup-hidup Shishakli, dan memaksa Paul dan para penyintas untuk melakukan perjalanan ke selatan. Saat tiba, Paul meminum Air Kehidupan dan jatuh koma. Hal ini membuat Chani marah, tetapi Jessica memaksanya untuk mencampur air matanya dengan cairan tersebut, yang membangunkan Paul. Sekarang memiliki kewaskitaan parsial melintasi ruang dan waktu, Paul melihat Alia dewasa di Arrakis yang terisi air. Ia juga melihat satu jalan menuju kemenangan di antara semua kemungkinan masa depan, dan bahwa Jessica adalah putri Baron Harkonnen. Paul bertemu dengan dewan perang Fremen selatan, membangkitkan semangat Stilgar dan kerumunan dengan menunjukkan kemampuannya untuk memahami pikiran terdalam mereka. Ia menyatakan dirinya sebagai Lisan al Gaib dan mengirim tantangan kepada Shaddam, yang tiba di Arrakis bersama Irulan dan Sardaukar. Shaddam menghukum Harkonnens atas kegagalan mereka dan memutus alat bantu hidup Baron. Sementara itu, Fremen melancarkan serangan, menggunakan atom dan cacing pasir untuk mengalahkan Sardaukar. Paul mengeksekusi Baron dan menangkap Shaddam dan rombongannya. Sementara itu, Gurney memimpin serangan ke Arrakeen, mencegat dan membunuh Rabban.
Paul menantang Shaddam untuk merebut takhta dan, yang membuat Chani kecewa, menuntut untuk menikahi Irulan. Sebelumnya dipanggil oleh Baron, Keluarga Besar tiba di orbit, siap untuk menyerang planet ini, tetapi Paul mengancam akan menghancurkan ladang rempah-rempah dengan senjata atom jika mereka campur tangan. Feyd-Rautha mengajukan diri menjadi juara Shaddam, dan Paul membunuhnya dalam duel meskipun ditikam dua kali.
Irulan menyetujui permintaan Paul untuk menikah dengan syarat ayahnya tetap hidup. Shaddam menyerah, tetapi Keluarga Besar menolak kekuasaan Paul, jadi dia memerintahkan Fremen untuk menyerang armada yang mengorbit. Saat Stilgar memimpin Fremen ke kapal-kapal Sardaukar yang direbut, Jessica dan Alia merenungkan awal perang suci Paul.
Chani menolak untuk tunduk kepada Paul dan berangkat sendirian dengan cacing pasir.
